Bu sayfa, 26. Dünya Psikiyatri Kongresi'nde sunulan çalışmanın yapay zekâ desteğiyle hazırlanmış Türkçe özetidir. Çalışmanın sahibi sunan yazarlardır; atıf için orijinal kaynağa başvurun.

EV0644

Uzun okumalı nanopor epigenomik profilleme, idiyopatik ve sendromik otizm beyin dokusunda farklı 5mC ve 5hmC imzaları ortaya koymaktadır

LONG-READ NANOPORE EPIGENOMIC PROFILING REVEALS DISTINCT 5MC AND 5HMC SIGNATURES IN IDIOPATHIC AND SYNDROMIC AUTISM BRAIN TISSUE

Uzun okumalı nanopor dizileme, otizmde mikrodizi yöntemleriyle yakalanamayan yeni ve birbirinden farklı 5mC ve 5hmC değişimlerini göstermiş, Dup15q sendromunda SNORD bölgelerinde belirgin hipometilasyon saptanmıştır.

Amaç, otizmde daha önce yalnız 5-metilsitozin (5-methylcytosine, 5mC) üzerinde ve sınırlı çözünürlükle çalışılmış olan DNA metilasyon imzalarını, uzun okumalı Oxford Nanopore dizileme ile epigenom genelinde hem 5mC hem de 5-hidroksimetilsitozin (5-hydroxymethylcytosine, 5hmC) düzeyinde profillemekti. Örneklem, post mortem prefrontal korteks (Brodmann alanı 9) beyin dokusundan elde edilen 37 bireyden oluşmaktadır: 3 Dup15q sendromlu, 18 idiyopatik otizm spektrum bozukluğu (autism spectrum disorder, ASD) ve 16 nörotipik kontrol. Genomik DNA çıkarılıp dizilendikten sonra okumalar GRCh38 referansına hizalanmış, 5mC ve 5hmC sinyalleri Modkit ile ölçülmüş, farklı metillenmiş bölgeler (differentially methylated regions) yaş, cinsiyet, beyin bankası ve hücresel heterojenlik kontrol edilerek DMRSeq ile ikili karşılaştırmalarla belirlenmiş ve işlevsel anotasyon annotatr ile yapılmıştır. DMRSeq, otizmle ilişkili bilinen farklı metillenmiş lokusları doğrulamış; bu lokuslar nöronal düzenleme, sinaptik işlev ve gelişimsel süreçler açısından zenginleşmiş bulunmuştur. Analiz ayrıca mikrodizi dizilemesiyle daha önce yakalanmamış, yeni ve birbirinden ayrışan 5mC ve 5hmC değişimlerini ortaya koymuştur. Kromozom 15'e ilişkin bulgularda Dup15q örnekleri, otizmli ve nörotipik kontrollere kıyasla SNORD bölgelerinde 5mC düzeyinde belirgin hipometilasyon göstermiş, bu bulgu önceki literatürle uyumlu bulunmuştur. Yazarlar bu keşif çalışmasını, otistik, Dup15q sendromlu ve nörotipik bireylerin post mortem beyin dokusunda 5mC ve 5hmC imzalarının ilk doğrudan uzun okumalı karakterizasyonu olarak tanımlamakta; sonraki adımlar olarak eş metilasyon ağ analizi ve Dup15q örneklerinde yapısal varyasyon incelemesini önermektedir.

Tüm WCP 2026 özetleri