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SO062

Anksiyeteli ve anksiyetesiz depresyonu malignitelere bağlayan periferik kan transkriptomik örüntüleri: bütünleşik biyoinformatik analiz (चिंता-सहित और चिंता-रहित अवसाद को दुर्दमताओं से जोड़ने वाले परिधीय रक्त के ट्रांसक्रिप्टोमिक प्रतिरूप: एक एकीकृत जैवसूचनाविज्ञान विश्लेषण)

PERIPHERAL BLOOD TRANSCRIPTOMIC PATTERNS LINKING ANXIOUS AND NON-ANXIOUS DEPRESSION TO MALIGNANCIES: AN INTEGRATED BIOINFORMATICS ANALYSIS

चिंता-सहित अवसाद और दुर्दमता में प्रतिरक्षा तथा इंटरफेरॉन सिग्नलिंग के स्तर पर समानता दिखाई देती है, जबकि एंटीजन प्रस्तुतीकरण और mRNA प्रसंस्करण में भिन्नता पाई जाती है। यह इस संभावना का समर्थन करता है कि चिंता का विनिर्देशक जैविक रूप से सार्थक उपप्रकार को दर्शा सकता है।

इस अध्ययन का उद्देश्य चिंता के लक्षणों के साथ और उनके बिना होने वाले अवसाद के परिधीय रक्त ट्रांसक्रिप्टोमिक प्रोफ़ाइल की तुलना दुर्दमताओं से करके समान और स्थिति-विशिष्ट जीन अभिव्यक्ति प्रतिरूपों की पहचान करना था। दो सार्वजनिक रूप से उपलब्ध डेटासेट इस्तेमाल किए गए: GSE98793 (संपूर्ण रक्त; चिंता-सहित अवसाद, चिंता-रहित अवसाद और नियंत्रण समूह) तथा GSE27562 (परिधीय रक्त की एककेंद्रकीय कोशिकाएँ; दुर्दमता और नियंत्रण समूह); सार में समूहों के आकार क्रमशः 64, 64, 64 तथा 79 और 31 बताए गए हैं। विभेदक रूप से अभिव्यक्त जीनों (differentially expressed genes, DEG) की पहचान R परिवेश में limma की सहायता से, पोस्टर में बताए गए असमायोजित p<0,01 कटऑफ़ मान के आधार पर की गई; साझा जीनों का नियमन एक ही दिशा में होने पर उन्हें अतिव्यापन (overlap) और विपरीत दिशाओं में होने पर अभिसरण (convergence) के रूप में वर्गीकृत किया गया। कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण ShinyGO की सहायता से Gene Ontology और KEGG के माध्यम से किया गया। चिंता-सहित अवसाद में अतिव्यापी जीन टाइप II इंटरफेरॉन (IFN-गामा) प्रतिक्रिया और जन्मजात प्रतिरक्षा, mRNA की स्थिरता तथा अपचय के नियमन, फोकल आसंजन और KEGG के अमीनो शर्करा तथा न्यूक्लियोटाइड शर्करा चयापचय से संबंधित प्रक्रियाओं में केंद्रित थे। इसी समूह में विपरीत दिशाओं में विनियमित जीनों ने MHC वर्ग II के माध्यम से एंटीजन प्रसंस्करण और प्रस्तुतीकरण, mRNA प्रसंस्करण और स्प्लाइसिंग, तथा प्रोटीन सेरीन/थ्रेओनीन काइनेज़ और यूबिक्विटिन लाइगेज़ गतिविधि की ओर संकेत किया; KEGG स्तर पर कोई भी मार्ग सांख्यिकीय सार्थकता तक नहीं पहुँचा। चिंता-रहित अवसाद में अतिव्यापन नाइट्रोजन और ऑक्सीजन युक्त यौगिकों के प्रति कोशिकीय तनाव प्रतिक्रिया, पुटिका-मध्यस्थित परिवहन और कोशिका सक्रियण तथा KEGG के ऑस्टियोक्लास्ट विभेदन और शिगेलोसिस मार्गों में पाया गया; वहीं विपरीत दिशाओं में विनियमित जीन ग्लूकोज़/ग्लूकागॉन चयापचय और एनोइकिस के नियमन, कोशिका-कोशिका तथा एडहेरेंस संधियों, बीटा2 एड्रीनर्जिक और TGF बीटा रिसेप्टर सिग्नलिंग तथा KEGG के ग्लूकागॉन सिग्नलिंग और HPV संक्रमण मार्ग के आसपास समूहित थे। पोस्टर के मुख्य संदेश के अनुसार, चिंता-सहित अवसाद और दुर्दमता में प्रतिरक्षा तथा इंटरफेरॉन सिग्नलिंग के स्तर पर समानता है, लेकिन एंटीजन प्रस्तुतीकरण और mRNA प्रसंस्करण में भिन्नता है; दूसरी ओर, चिंता-रहित अवसाद सामान्य तनाव और पुटिकीय परिवहन से संबंधित जैविक प्रक्रियाएँ साझा करता है, लेकिन चयापचय और एनोइकिस के नियमन वाले मार्गों में भिन्नता दिखाता है। यह प्रतिरूप इस संभावना का समर्थन करता है कि चिंता का विनिर्देशक मनो-कैंसरविज्ञान संबंधी जोखिम स्तरीकरण की दृष्टि से जैविक रूप से सार्थक उपप्रकार को दर्शा सकता है।

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