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Esta página es un resumen en turco, elaborado con ayuda de inteligencia artificial, del trabajo presentado en el 26.º Congreso Mundial de Psiquiatría. El trabajo pertenece a los autores que lo presentan; para citarlo, consulte la fuente original.

EV0644

El perfilado epigenómico mediante nanoporos de lectura larga revela firmas distintas de 5mC y 5hmC en tejido cerebral de personas con autismo idiopático y sindrómico

LONG-READ NANOPORE EPIGENOMIC PROFILING REVEALS DISTINCT 5MC AND 5HMC SIGNATURES IN IDIOPATHIC AND SYNDROMIC AUTISM BRAIN TISSUE

La secuenciación mediante nanoporos de lectura larga ha revelado alteraciones nuevas y diferenciadas de 5mC y 5hmC en el autismo que no se detectaban mediante métodos de microarrays, y ha identificado una hipometilación marcada en las regiones SNORD en el síndrome Dup15q.

El objetivo fue caracterizar, mediante secuenciación de lectura larga de Oxford Nanopore, las firmas de metilación del ADN en el autismo en todo el epigenoma, tanto a nivel de 5-metilcitosina (5-methylcytosine, 5mC) como de 5-hidroximetilcitosina (5-hydroxymethylcytosine, 5hmC), dado que anteriormente solo se habían estudiado a nivel de 5mC y con una resolución limitada. La muestra comprendió tejido cerebral post mortem de la corteza prefrontal (área 9 de Brodmann) de 37 individuos: 3 con síndrome Dup15q, 18 con trastorno del espectro autista idiopático (autism spectrum disorder, ASD) y 16 controles neurotípicos. Tras la extracción y secuenciación del ADN genómico, las lecturas se alinearon con la referencia GRCh38, las señales de 5mC y 5hmC se cuantificaron con Modkit, las regiones diferencialmente metiladas (differentially methylated regions) se identificaron mediante comparaciones por pares con DMRSeq, controlando la edad, el sexo, el banco de cerebros y la heterogeneidad celular, y la anotación funcional se realizó con annotatr. DMRSeq confirmó loci diferencialmente metilados conocidos asociados al autismo; estos loci mostraron un enriquecimiento en funciones de regulación neuronal, función sináptica y procesos del desarrollo. El análisis también reveló alteraciones nuevas y diferenciadas de 5mC y 5hmC que no se habían detectado previamente mediante secuenciación con microarrays. En los hallazgos relativos al cromosoma 15, las muestras Dup15q mostraron una hipometilación marcada a nivel de 5mC en las regiones SNORD en comparación con las muestras de personas con autismo y los controles neurotípicos, un resultado concordante con la literatura previa. Los autores describen este estudio exploratorio como la primera caracterización directa mediante lecturas largas de las firmas de 5mC y 5hmC en tejido cerebral post mortem de personas autistas, personas con síndrome Dup15q y personas neurotípicas; como próximos pasos, proponen un análisis de redes de com metilación y un estudio de la variación estructural en las muestras Dup15q.

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